Les vestiges archéologiques les plus anciens de la municipalité témoignent de la présence humaine dans la région dès l'occupation romaine de la péninsule Ibérique. On sait aujourd'hui que d'importantes exploitations aurifères existaient à cette époque dans la Serra et la vallée de la Ceira.
L' origine de Lousã nous ramène à l'époque de la domination musulmane, lorsqu'un roi ou émir nommé Arunce aurait fondé le château pour protéger sa fille Peralta lors de sa campagne en Afrique du Nord. Coimbra était alors un important centre mozarabe, doté d'une culture vivante et d'une activité économique bien plus développées que celles d'autres villages au nord du territoire portugais actuel.
C'est au XVIIIe siècle que Lousã connut son apogée, passant d'un village modeste et atypique à un village florissant, aux rues pavées de bâtiments neufs et bien agencés, où résidaient les familles nobles. La création locale de l'industrie papetière, la papeterie de Penedo, et ses produits étaient d'une telle qualité qu'ils fournissaient la prestigieuse typographie de la Companhia de Jesus de Coimbra, dont les clients rejoignirent la Typographie Académique et la Monnaie.
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